การเลือกใช้โปรแกรมสำหรับการวิเคราะห์และแปลผลข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ให้เป็นข้อมูลชีวสารสนเทศ (bioinformatics) มีความสำคัญมากสำหรับผู้ที่มีการประยุกต์ใช้เทคนิค next generation sequencing ทั้งในการทำงานและงานวิจัย เพื่อจะได้มีการนำไปใช้ประโยชน์ได้สูงสุด

จากการที่ได้เข้าฟังการอบรมเชิงปฏิบัติการเรือ่ง bioinformatics for microbiologists โดย Dr.Apichai Tuanyok, Assistant professor, Department of infectious Diseases and pathology , colleage of veterinary medicine, University of Florida เมื่อวันที่ 13-14 มิถุนายน 2561 ได้พบว่า การเลือกใช้โปรแกรมสำหรับการวิเคราะห์และแปลผลข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ให้เป็นข้อมูลชีวสารสนเทศ มีความสำคัญมากต่อการประยุกต์ใช้เทคนิค next generation sequencing ทั้งในเรื่องของการแปลผล ความถูกต้องของข้อมูล การประยุกต์ใช้ database ซึ่งมีเครื่องมือที่สามารถนำมาประยุกต์ใช้หลายรูปแบบได้แก่ BLAST, Artemis comparison tool (ACT), Rapid Annotation using subsystem technology และ Pathosystem resource integration center.